新冠病毒基因自動化鑒定雲平台VIC

7.6.1抗疫期間所解決的業務需求

新冠病毒基因自動化分析、快速鑒定。

7.6.2解決方案及特色

VIC 平台實現了從病毒組基因組測序到基因組拚接與鑒定的“一鍵式”自動化服務，極大簡化了操作流程。各醫院隻需上傳病例原始數據 至 VIC 平 台 （ http://www.biosino.org/vic/ 和http://hvic.biosino.org/），即可觸發病毒基因分析流程，並獲得該病例的全基因組分析結果。VIC 得到華為雲容器平台強大計算能力的支持，可提供高通量多樣本並行雲端分析能力。分析結果不僅能為全麵分析患者的呼吸道病毒組、研究其致病因子提供支撐，亦可助力臨床診斷，為采用相應的治療措施提供參考，同時還可監測病毒變異趨勢，便於提前做出應對措施。

圖 7-2 病毒鑒定的技術處理流程

7.6.3應用與效果

2 月 10 日，中國科學院上海營養與健康研究所、中國科學院上海巴斯德研究所共同開發，華為提供雲計算技術支撐的病毒基因組自動化鑒定雲平台（Virus Identification Cloud， VIC）在華為雲正式上線。

該平台直接對接人體樣本的 RNA 二代測序原始數據，具有對數據全自動質量控製、拚接和病毒組成分析等功能，實現了快速檢測樣本中可能存在的包括新冠病毒在內的各種病毒，並在線分析其相對載量。

7.6.4產學研結合情況及效果

VIC 由中國科學院上海巴斯德研究所大數據平台設計，由中國科學院上海營養與健康研究所生物醫學大數據中心開發、運維並提供技術支撐，由華為雲基因容器提供雲服務技術支撐。

VIC 平台隻作為一個計算平台，所有的數據權利屬於數據提供方， 平台不使用用戶數據去發表任何科研論文。疫情期間，VIC 麵向科研用戶免費開放。

目前，上海市公共衛生臨床中心，上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院、中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院作為平台的首批用戶， 已在 VIC 上完成了批量新冠肺炎患者樣本的基因組原始測序數據分析。

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